生态环境部门对黑烟车抓拍违规车辆报警处理的过程，通常涉及多个环节和部门间的协作，以下是对这一过程的详细解析：

一、抓拍与取证

1. 黑烟车抓拍设备：生态环境部门会利用黑烟车电子抓拍设备对道路上行驶的机动车进行监控，特别是针对排放黑烟等明显可视污染物的车辆。这些设备通常安装在交通要道或重点区域，能够自动捕捉黑烟排放的瞬间。
2. 取证要求：抓拍设备所拍摄的图片和视频需要满足一定的技术要求，以确保取证的有效性。例如，图片应能清晰辨别机动车后部全貌、号牌、颜色、车型及显著地理特征的全景特征，同时能清晰辨认机动车排放黑烟。视频则应清晰记录机动车违法行为过程。

二、审核与确认

1. 人工审核：生态环境部门会对抓拍到的黑烟车违法行为进行人工审核，以确保抓拍的准确性。审核过程中，会参照相关标准（如林格曼黑度）对车辆排气污染物颜色进行判断。
2. 确认违法：经过审核后，如果确认车辆存在黑烟排放的违法行为，生态环境部门会将违法车辆信息及取证信息等相关证据移交至公安交通管理部门。

三、处罚与整改

1. 处罚依据：根据《中华人民共和国大气污染防治法》和《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，驾驶排放检验不合格的机动车上道路行驶的，将受到相应的处罚。具体来说，机动车驾驶人可能面临警告或20元以上200元以下的罚款。
2. 处罚执行：公安交通管理部门在收到生态环境部门移交的违法证据后，会进行审核确认并录入道路交通违法信息管理系统。随后，会向机动车所有人或驾驶人发送处罚通知，并要求其进行整改。
3. 整改要求：机动车驾驶人或所有人在收到处罚通知后，需要及时对机动车进行维修治理，确保尾气排放达标。同时，还需要按照要求申请解锁机动车年检重点监管名单，以便进行正常的年检。

四、后续监管与宣传

1. 后续监管：生态环境部门会持续关注黑烟车的整改情况，并定期对整改后的车辆进行复查。如果发现车辆仍未达到排放标准，将依法进行进一步处理。
2. 宣传教育：为了增强公众的环保意识，生态环境部门还会开展相关的宣传教育活动，提醒机动车驾驶人或所有人及时关注机动车的安全性能与车辆排放污染物是否超标，并积极配合政府的环保工作。

综上所述，生态环境部门对黑烟车抓拍违规车辆报警处理的过程是一个涉及多个环节和部门间协作的复杂过程。通过这一过程的实施，可以有效地打击黑烟车违法行为，保护大气环境质量。