治超非现场执法系统主要处罚的是那些违反道路交通安全法规，特别是存在超限超载行为的车辆。这些车辆包括但不限于以下几种：

1. 公路客运车辆：

• 如果载客超过额定乘员，将受到处罚。
• 如果超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货，将受到更严厉的处罚。

2. 货运机动车：

• 如果超过核定载质量，将受到处罚。
• 如果超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客，将受到更严厉的处罚。

3. 其他超限超载车辆：

• 包括但不限于砂石料运输车、矿山运输车等，这些车辆如果装载超过规定限制，也将受到处罚。

在具体处罚时，治超非现场执法系统会依据《中华人民共和国道路交通安全法》以及相关的管理规定进行。例如，根据《超限运输车辆行驶公路管理规定》第四十三条第二款，对于非现场执法查处的超限超载运输车辆，如果其超过限定标准但未超过1000千克，将予以警告；如果超过1000千克，则每超1000千克罚款500元，但最高不超过30000元。

此外，如果运输单位的车辆存在上述超限超载行为，并且经过处罚后仍未改正，那么对直接负责的主管人员也将进行处罚，罚款金额在2000元以上5000元以下。

总的来说，治超非现场执法系统主要针对的是那些违反道路交通安全法规，特别是存在超限超载行为的车辆。这些行为不仅会对道路交通安全构成威胁，还会对公路基础设施造成损坏，因此必须受到严格的处罚和管理。